Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cul4aQ3TCH7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cul4aQ3TCH7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms