Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VrtnQ3SYK4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VrtnQ3SYK4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
VrtnQ3SYK4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VrtnQ3SYK4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms