Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hddc2Q3SXD3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hddc2Q3SXD3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hddc2Q3SXD3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hddc2Q3SXD3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hddc2Q3SXD3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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