Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Riiad1Q3KNY5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Riiad1Q3KNY5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Riiad1Q3KNY5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Riiad1Q3KNY5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms