Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Shroom4Q1W617 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Shroom4Q1W617 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Shroom4Q1W617 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Shroom4Q1W617 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Shroom4Q1W617 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Shroom4Q1W617 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
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Shroom4Q1W617 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Shroom4Q1W617 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Shroom4Q1W617 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Shroom4Q1W617 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Shroom4Q1W617 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Shroom4Q1W617 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Shroom4Q1W617 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Shroom4Q1W617 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Shroom4Q1W617 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Shroom4Q1W617 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Shroom4Q1W617 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Shroom4Q1W617 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Shroom4Q1W617 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Shroom4Q1W617 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Shroom4Q1W617 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms