Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lingo4Q149C3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lingo4Q149C3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lingo4Q149C3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lingo4Q149C3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lingo4Q149C3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lingo4Q149C3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lingo4Q149C3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lingo4Q149C3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lingo4Q149C3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lingo4Q149C3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lingo4Q149C3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lingo4Q149C3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lingo4Q149C3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lingo4Q149C3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lingo4Q149C3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lingo4Q149C3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lingo4Q149C3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lingo4Q149C3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms