Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp2b3Q0VF55 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp2b3Q0VF55 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Atp2b3Q0VF55 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp2b3Q0VF55 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1612 ms