Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc138Q0VF22 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc138Q0VF22 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc138Q0VF22 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms