Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 583.5 ms