Protein–RNA interactions for Protein: Q08775

Runx2, Runt-related transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx2Q08775 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Runx2Q08775 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Runx2Q08775 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Runx2Q08775 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Runx2Q08775 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Runx2Q08775 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Runx2Q08775 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Runx2Q08775 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Runx2Q08775 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Runx2Q08775 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Runx2Q08775 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Runx2Q08775 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Runx2Q08775 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Runx2Q08775 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Runx2Q08775 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Runx2Q08775 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms