Protein–RNA interactions for Protein: Q08639

Tfdp1, Transcription factor Dp-1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp1Q08639 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfdp1Q08639 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfdp1Q08639 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tfdp1Q08639 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tfdp1Q08639 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms