Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrx2Q06348 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prrx2Q06348 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prrx2Q06348 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms