Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Thbs2Q03350 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Thbs2Q03350 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms