Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ddr1Q03146 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ddr1Q03146 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ddr1Q03146 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ddr1Q03146 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms