Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Htr1fQ02284 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Htr1fQ02284 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Htr1fQ02284 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms