Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ascl1Q02067 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ascl1Q02067 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ascl1Q02067 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms