Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apba2P98084 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Apba2P98084 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Apba2P98084 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Apba2P98084 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Apba2P98084 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apba2P98084 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Apba2P98084 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apba2P98084 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Apba2P98084 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Apba2P98084 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Apba2P98084 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apba2P98084 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apba2P98084 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Apba2P98084 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apba2P98084 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Apba2P98084 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Apba2P98084 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms