Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gfra1P97785 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gfra1P97785 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms