Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps45P97390 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps45P97390 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps45P97390 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps45P97390 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps45P97390 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps45P97390 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps45P97390 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps45P97390 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps45P97390 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps45P97390 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps45P97390 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps45P97390 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps45P97390 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps45P97390 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps45P97390 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps45P97390 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps45P97390 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps45P97390 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps45P97390 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps45P97390 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps45P97390 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps45P97390 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps45P97390 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms