Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Psme1P97371 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Psme1P97371 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Psme1P97371 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Psme1P97371 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Psme1P97371 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Psme1P97371 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Psme1P97371 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Psme1P97371 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Psme1P97371 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Psme1P97371 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Psme1P97371 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Psme1P97371 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Psme1P97371 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Psme1P97371 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Psme1P97371 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Psme1P97371 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Psme1P97371 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Psme1P97371 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Psme1P97371 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Psme1P97371 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Psme1P97371 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Psme1P97371 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Psme1P97371 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Psme1P97371 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Psme1P97371 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Psme1P97371 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Psme1P97371 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Psme1P97371 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Psme1P97371 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Psme1P97371 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Psme1P97371 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms