Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Meis3P97368 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis3P97368 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis3P97368 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Meis3P97368 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis3P97368 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis3P97368 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Meis3P97368 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Meis3P97368 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Meis3P97368 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Meis3P97368 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms