Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx1P83917 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx1P83917 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx1P83917 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx1P83917 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms