Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Otx1P80205 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otx1P80205 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx1P80205 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx1P80205 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx1P80205 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otx1P80205 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otx1P80205 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otx1P80205 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otx1P80205 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otx1P80205 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx1P80205 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx1P80205 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otx1P80205 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms