Protein–RNA interactions for Protein: P70428

Ext2, Exostosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext2P70428 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ext2P70428 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ext2P70428 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ext2P70428 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ext2P70428 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ext2P70428 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ext2P70428 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ext2P70428 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ext2P70428 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ext2P70428 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ext2P70428 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ext2P70428 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ext2P70428 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ext2P70428 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ext2P70428 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ext2P70428 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ext2P70428 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ext2P70428 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ext2P70428 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ext2P70428 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ext2P70428 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ext2P70428 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ext2P70428 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ext2P70428 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ext2P70428 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ext2P70428 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ext2P70428 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ext2P70428 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ext2P70428 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ext2P70428 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ext2P70428 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ext2P70428 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ext2P70428 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ext2P70428 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ext2P70428 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ext2P70428 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ext2P70428 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ext2P70428 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ext2P70428 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ext2P70428 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ext2P70428 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ext2P70428 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ext2P70428 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ext2P70428 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ext2P70428 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ext2P70428 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ext2P70428 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ext2P70428 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ext2P70428 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ext2P70428 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ext2P70428 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ext2P70428 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ext2P70428 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms