Protein–RNA interactions for Protein: P70194

Clec4f, C-type lectin domain family 4 member F, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4fP70194 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clec4fP70194 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clec4fP70194 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clec4fP70194 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms