Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Abcc9P70170 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Abcc9P70170 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Abcc9P70170 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Abcc9P70170 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Abcc9P70170 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Abcc9P70170 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC45.24■■■■■ 4.83
Abcc9P70170 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC45.23■■■■■ 4.83
Abcc9P70170 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
Abcc9P70170 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
Abcc9P70170 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
Abcc9P70170 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
Abcc9P70170 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Abcc9P70170 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Abcc9P70170 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC45.15■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC45.15■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC45.13■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
Abcc9P70170 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Abcc9P70170 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Abcc9P70170 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
Abcc9P70170 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
Abcc9P70170 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Abcc9P70170 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
Abcc9P70170 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
Abcc9P70170 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
Abcc9P70170 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
Abcc9P70170 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Abcc9P70170 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
Abcc9P70170 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
Abcc9P70170 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Abcc9P70170 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Abcc9P70170 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
Abcc9P70170 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC45.07■■■■■ 4.81
Abcc9P70170 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
Abcc9P70170 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC45.06■■■■■ 4.8
Abcc9P70170 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC45.06■■■■■ 4.8
Abcc9P70170 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Abcc9P70170 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Abcc9P70170 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Abcc9P70170 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Abcc9P70170 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC45.03■■■■■ 4.8
Abcc9P70170 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
Abcc9P70170 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC45.02■■■■■ 4.8
Abcc9P70170 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
Abcc9P70170 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
Abcc9P70170 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
Abcc9P70170 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
Abcc9P70170 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
Abcc9P70170 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
Abcc9P70170 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
Abcc9P70170 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
Abcc9P70170 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Abcc9P70170 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC44.97■■■■■ 4.79
Abcc9P70170 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Abcc9P70170 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Abcc9P70170 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Abcc9P70170 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC44.97■■■■■ 4.79
Abcc9P70170 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Abcc9P70170 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Abcc9P70170 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Abcc9P70170 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
Abcc9P70170 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.95■■■■■ 4.79
Abcc9P70170 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
Abcc9P70170 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC44.95■■■■■ 4.79
Abcc9P70170 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Abcc9P70170 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Abcc9P70170 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
Abcc9P70170 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
Abcc9P70170 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC44.92■■■■■ 4.78
Abcc9P70170 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Abcc9P70170 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
Abcc9P70170 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
Abcc9P70170 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
Abcc9P70170 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
Abcc9P70170 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC44.9■■■■■ 4.78
Abcc9P70170 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
Abcc9P70170 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.89■■■■■ 4.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms