Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl18aP62717 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl18aP62717 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl18aP62717 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl18aP62717 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl18aP62717 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rpl18aP62717 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rpl18aP62717 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms