Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcif1P59114 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcif1P59114 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms