Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P58686 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P58686 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P58686 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P58686 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P58686 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P58686 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P58686 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P58686 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P58686 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
P58686 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P58686 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P58686 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P58686 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P58686 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P58686 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P58686 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P58686 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P58686 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P58686 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P58686 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P58686 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P58686 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
P58686 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P58686 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P58686 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P58686 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P58686 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P58686 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P58686 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P58686 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P58686 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P58686 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P58686 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P58686 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P58686 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P58686 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P58686 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P58686 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P58686 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P58686 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P58686 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P58686 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P58686 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P58686 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P58686 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P58686 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P58686 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P58686 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P58686 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P58686 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P58686 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P58686 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P58686 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P58686 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P58686 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P58686 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P58686 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P58686 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P58686 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P58686 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P58686 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P58686 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P58686 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P58686 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P58686 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P58686 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P58686 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P58686 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P58686 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P58686 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P58686 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P58686 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P58686 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P58686 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P58686 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P58686 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P58686 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P58686 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P58686 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P58686 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P58686 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P58686 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P58686 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P58686 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P58686 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P58686 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P58686 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P58686 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P58686 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P58686 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P58686 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P58686 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P58686 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P58686 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P58686 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P58686 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P58686 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P58686 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P58686 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms