Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CckbrP56481 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CckbrP56481 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CckbrP56481 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CckbrP56481 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CckbrP56481 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CckbrP56481 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CckbrP56481 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CckbrP56481 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CckbrP56481 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CckbrP56481 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CckbrP56481 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CckbrP56481 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CckbrP56481 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CckbrP56481 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CckbrP56481 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CckbrP56481 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CckbrP56481 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CckbrP56481 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.3 ms