Protein–RNA interactions for Protein: P56450

Mc4r, Melanocortin receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc4rP56450 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mc4rP56450 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mc4rP56450 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mc4rP56450 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms