Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PltpP55065 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PltpP55065 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PltpP55065 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PltpP55065 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PltpP55065 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PltpP55065 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PltpP55065 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PltpP55065 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PltpP55065 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PltpP55065 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PltpP55065 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PltpP55065 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PltpP55065 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PltpP55065 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PltpP55065 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PltpP55065 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PltpP55065 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PltpP55065 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PltpP55065 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PltpP55065 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PltpP55065 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PltpP55065 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PltpP55065 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PltpP55065 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PltpP55065 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PltpP55065 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PltpP55065 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PltpP55065 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PltpP55065 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PltpP55065 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PltpP55065 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PltpP55065 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PltpP55065 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PltpP55065 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PltpP55065 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PltpP55065 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PltpP55065 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PltpP55065 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PltpP55065 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PltpP55065 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PltpP55065 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PltpP55065 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PltpP55065 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PltpP55065 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PltpP55065 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PltpP55065 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PltpP55065 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PltpP55065 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PltpP55065 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PltpP55065 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PltpP55065 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PltpP55065 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PltpP55065 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PltpP55065 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PltpP55065 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PltpP55065 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PltpP55065 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PltpP55065 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PltpP55065 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PltpP55065 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PltpP55065 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PltpP55065 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PltpP55065 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PltpP55065 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PltpP55065 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PltpP55065 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PltpP55065 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PltpP55065 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PltpP55065 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PltpP55065 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PltpP55065 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PltpP55065 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PltpP55065 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PltpP55065 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PltpP55065 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PltpP55065 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PltpP55065 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PltpP55065 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PltpP55065 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PltpP55065 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PltpP55065 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PltpP55065 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PltpP55065 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PltpP55065 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PltpP55065 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PltpP55065 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PltpP55065 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PltpP55065 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PltpP55065 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PltpP55065 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PltpP55065 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PltpP55065 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PltpP55065 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PltpP55065 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PltpP55065 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PltpP55065 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PltpP55065 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PltpP55065 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PltpP55065 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms