Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Psmc4P54775 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Psmc4P54775 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc4P54775 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms