Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pms2P54279 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pms2P54279 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pms2P54279 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pms2P54279 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pms2P54279 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pms2P54279 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pms2P54279 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pms2P54279 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Pms2P54279 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms2P54279 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pms2P54279 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pms2P54279 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pms2P54279 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pms2P54279 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pms2P54279 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pms2P54279 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pms2P54279 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pms2P54279 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms