Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrp3P50462 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrp3P50462 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Csrp3P50462 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrp3P50462 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Csrp3P50462 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Csrp3P50462 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrp3P50462 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrp3P50462 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrp3P50462 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrp3P50462 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Csrp3P50462 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Csrp3P50462 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrp3P50462 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrp3P50462 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrp3P50462 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Csrp3P50462 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrp3P50462 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Csrp3P50462 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Csrp3P50462 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csrp3P50462 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrp3P50462 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms