Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmod1P49813 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmod1P49813 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmod1P49813 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms