Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc3P49135 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ercc3P49135 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms