Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nkx1-2P42580 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nkx1-2P42580 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nkx1-2P42580 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms