Protein–RNA interactions for Protein: P35486

Pdha1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdha1P35486 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdha1P35486 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdha1P35486 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdha1P35486 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdha1P35486 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms