Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxa11P31311 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxa11P31311 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxa11P31311 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms