Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxa10P31310 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa10P31310 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms