Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tacr1P30548 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tacr1P30548 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms