Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd10P28359 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd10P28359 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd10P28359 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxd10P28359 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms