Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Itgb7P26011 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itgb7P26011 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itgb7P26011 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms