Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmo2P25801 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmo2P25801 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lmo2P25801 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lmo2P25801 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms