Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hoxd12P23812 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxd12P23812 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd12P23812 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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