Protein–RNA interactions for Protein: P21658

Fgf6, Fibroblast growth factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf6P21658 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fgf6P21658 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fgf6P21658 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 190.2 ms