Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CtsdP18242 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsdP18242 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsdP18242 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsdP18242 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CtsdP18242 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CtsdP18242 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CtsdP18242 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsdP18242 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsdP18242 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsdP18242 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsdP18242 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CtsdP18242 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CtsdP18242 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CtsdP18242 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsdP18242 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CtsdP18242 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsdP18242 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CtsdP18242 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CtsdP18242 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsdP18242 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsdP18242 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsdP18242 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsdP18242 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CtsdP18242 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CtsdP18242 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CtsdP18242 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CtsdP18242 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CtsdP18242 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtsdP18242 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtsdP18242 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtsdP18242 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CtsdP18242 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CtsdP18242 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CtsdP18242 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CtsdP18242 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtsdP18242 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CtsdP18242 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CtsdP18242 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CtsdP18242 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsdP18242 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsdP18242 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsdP18242 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsdP18242 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CtsdP18242 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CtsdP18242 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CtsdP18242 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CtsdP18242 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CtsdP18242 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms