Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gata1P17679 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata1P17679 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata1P17679 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata1P17679 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata1P17679 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata1P17679 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata1P17679 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gata1P17679 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata1P17679 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata1P17679 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata1P17679 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gata1P17679 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms