Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmga1P17095 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmga1P17095 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hmga1P17095 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hmga1P17095 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms